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Das hängt jetzt ein wenig von Deinem Betriebssystem ab.
Unter Windows gibt es in den Einstellungen des Explorers irgendwo die Zuordnung der Extension (z. B. *.odt) zu einem Programm. Wenn Du jetzt *.odt dem Thunderbird zugeordnet hast, passiert das, was Du beschreibst. Solltest Du die Einstellung nicht finden, installiere einfach LO nochmal neu, dann trägt er das vielleicht wieder richtig ein. Umschalttaste-Rechtsklick bietet im Kontextmenü auch ein "Öffnen mit..." an, das hilft ja auch erst mal.