縦書きの状態でＰＤＦ化すると、読点などの位置がおかしくなります。入力中はなにも問題はないのですが。。
使っているフォントは游明朝です。
明朝体などの一般的なフォントではＰＤＦ化しても普通に表示されます。
予め言っておくが、このコメントでは解決策を示す気はない。
メイリオ on Windows 10 ver 1607でも、
少なくとも文字が他の行と比較して低い位置に表示される現象が
文字列"abcde"では再現せず、"あいうえお"では再現した。 段落区切りのみならず改行でも再現する。
おそらく、
https://support.microsoft.com/ja-jp/kb/929742
等と同根で、フォント自体に指定されているレディングが原因と予想。
実際、
http://www.geocities.jp/meir000/meiryoKe/
のパッチを使い、生成したファイルを用いてMeiryoKe_Consoleを指定してみたところ、問題が再現できず、MeiryoKe_Gothicでは再現した。
参考情報:
MeiryoKe_ConsoleをFontForgeで情報を見たとき、
Win Ascentが1731、Win Descentが317、 組版上の高さが1798、組版上の深さが250に指定されている(ので、(1731 + 317) / (1798 + 250) = 2048 / 2048 = 1まではわかる)が、パッチ製作者がどのような考えのもとこの値を選んだのか等、自分の理解が怪しいので回答ではなくコメントとしたかった…のだが字数制限に引っかかったorz
以下はあまり根拠が無いこと。
あたりが関わっているのではないかとhimajin100000は推測しており、もしかしたらLinuxでは再現しないかもしれない(= 検証できる人が減る)と思っている。